Descrizione del parametro: Per aborto si intende l’interruzione della gravidanza con espulsione del feto prima che sia atto alla vita extrauterina. L’aborto nei grandi e piccoli ruminanti rappresenta uno dei principali motivi di mancato introito da parte dell’allevatore, non solo per la morte del nascituro ma anche per la mancata produzione di latte e per eventuali complicazioni post-aborto. Accertare le cause di tale evento è quindi fondamentale per prevenire il ripetersi di tali episodi sia per l’economia dell’azienda, sia per evitare conseguenze in ambito di sanità pubblica allorché le cause siano di origine infettiva. Tra le cause di aborto, sia nei bovini che negli ovi-caprini, le componenti di natura infettiva svolgono ancora oggi un ruolo importante. Tra i patogeni riconosciuti essere causa di aborti si distinguono: Bovine herpesvirus 4, Brucella sp, Bluetongue virus, Campylobacter jejuni, Chlamidophila abortus, Coxiella burnetii, Leptospira interrogans, Listeria monocytogenes, Neospora caninum, Salmonella enterica, Schmallenberg virus, Toxoplasma gondii, Caprine alphaherpesvirus 1; ma vanno anche i patogeni emergenti, opportunisti ed occasionali quali agenti micotici (Aspergillus), altri agenti batterici (Trueperella pyogenes, Escherichia coli, Bacillus spp., Streptococcus spp., Mycoplasma spp.) e parassitari (Trichomonas foetus, Anaplasma marginale).
Possibili Applicazioni: L’individuazione degli agenti abortigeni è una metodica è importante per monitorare il benessere animale, per migliorare le performance di un allevamento, per valutare lo stato di salute dell’animale.
Metodo di analisi: AMPLISEQ ILLUMINA: PANNELLO PATOGENI ABORTIGENI. La procedura si applica a campioni di acidi nucleici (DNA e RNA) estratti da tessuti, organi e tamponi prelevati da bovini e ovi-caprini per l’amplificazione e il sequenziamento di regioni target specifiche di 13 agenti abortigeni (Bovine herpesvirus 4, Brucella sp, Bluetongue virus, Campylobacter jejuni, Chlamidophila abortus, Coxiella burnetii, Leptospira interrogans, Listeria monocytogenes, Neospora caninum, Salmonella enterica, Schmallenberg virus, Toxoplasma gondii, Caprine alphaherpesvirus 1). Le librerie dei target genomici dei campioni preparate con il kit AmpliSeq for Illumina On-Demand, Custom and Community Panels vengono poi sequenziate con tecnologia Next Generation Sequencing (NGS) su piattaforma MiSeq Illumina.
